From 2eeceb4eb2a803d42133dc30a07f9a89d339c753 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Micha Wijesingha Ahchige <micwij@gmail.com>
Date: Mon, 21 Oct 2024 13:30:59 +0100
Subject: [PATCH] changed LSTrAP folder structure

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 runs/LSTrAP                                   |     1 -
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 16 files changed, 511200 insertions(+), 1 deletion(-)
 delete mode 160000 runs/LSTrAP
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 create mode 100644 runs/LSTrAP_output/3698_J_run535_TACATGTA_S204_L007.htseq
 create mode 100644 runs/LSTrAP_output/3698_K_run535_GCGCTTGA_S205_L007.htseq
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 create mode 100644 runs/LSTrAP_output/3698_M_run535_CTAACACG_S206_L007.htseq
 create mode 100644 runs/LSTrAP_output/3698_N_run531_CCGTAGGA_S259_L007.htseq
 create mode 100644 runs/LSTrAP_output/3698_O_run535_CAGGTGTC_S207_L007.htseq

diff --git a/runs/LSTrAP b/runs/LSTrAP
deleted file mode 160000
index 26d3e61b..00000000
--- a/runs/LSTrAP
+++ /dev/null
@@ -1 +0,0 @@
-Subproject commit 26d3e61bf5c15b9dd07199b9bb26ada54ef4c01c
diff --git a/runs/LSTrAP_output/3698_A_run535_TTCTCCGA_S199_L007.htseq b/runs/LSTrAP_output/3698_A_run535_TTCTCCGA_S199_L007.htseq
new file mode 100644
index 00000000..a96a2ae9
--- /dev/null
+++ b/runs/LSTrAP_output/3698_A_run535_TTCTCCGA_S199_L007.htseq
@@ -0,0 +1,34080 @@
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+Solyc11g011490.2.1	145
+Solyc11g011495.1.1	33
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+Solyc11g065050.1.1	0
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+Solyc01g103490.3.1	877
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