unify wording

workflows/kallisto_collect.R

 ö#!/usr/bin/env Rscript
 
 ################################################
-#### Test area (Within R)
+#### CWL-independent tests
 ################################################
 
 # arc_root <- "~/gitlab_dataplant/samplearc_rnaseq/"

workflows/kallisto_index.sh

@@ -4,7 +4,7 @@
 
 
 ################################################
-#### CWL-free tests
+#### CWL-independent tests
 ################################################
 
 # in_genome_ref=studies/TalinumGenomeDraft/resources/Talinum.gm.CDS.nt.fa

workflows/kallisto_quant.sh

@@ -4,7 +4,7 @@
 ### Note, this is written for single-end mode only
 
 ################################################
-#### CWL-free tests
+#### CWL-independent tests
 ################################################
 
 # arc_root=/Users/dominikbrilhaus/gitlab_dataplant/samplearc_rnaseq

workflows/kallisto_sleuth.R

@@ -5,14 +5,13 @@
 ################################################
 
 ################################################
-#### Test area (Within R)
+#### CWL-independent tests
 ################################################
 
 # arc_root <- "~/gitlab_dataplant/samplearc_rnaseq/"
 # in_sleuth <- "runs/kallisto_collect/kallisto_sleuthObject.RData"
 # out_folder <- "runs/kallisto_sleuth"
 
-
 ################################################
 #### Load required library
 ################################################

workflows/merge_isa_metadata.R

 #!/usr/bin/env Rscript
 
 ################################################
-#### Test area (Within R)
+#### CWL-independent tests
 ################################################
 
 # arc_root <- "~/gitlab_dataplant/samplearc_rnaseq/"

workflows/shiny_prep.R

 #!/usr/bin/env Rscript
 
 ################################################
-#### Test area (Within R)
+#### CWL-independent tests
 ################################################
 
 # arc_root <- "~/gitlab_dataplant/samplearc_rnaseq/"